En 1987 Maldonado contaba en Punta del Este con su primer curso universitario, los tres últimos años de la Facultad de Medicina de la Universidad de la República (Udelar), destinados a aquellos que querían terminar la carrera en la zona. Ya en 2012 la ciudad tenía ocho instituciones universitarias, 35 carreras de grado y 3.500 estudiantes. Actualmente un clúster trabaja en pos de que se convierta en una ciudad universitaria.